黑木耳是我國傳統的出口商品，目前已經實現規模化、袋料化栽培。但由於粗放的栽培方式、缺乏科學、配套的防治病蟲害措施，使得病蟲害日趨增加，危害增大，已成為黑木耳高產、穩產的重要限制因素。所以，有效地控制黑木耳病、蟲及雜菌的危害是實現黑木耳高產、穩產、優質的重要環節。
食用菌病、蟲及雜菌的防治一定要貫徹「預防為主、綜合防治」的方針。要特彆強調環境衛生和改進栽培技術措施的作用，選擇生長勢好、抗逆性強的品種，控制病、蟲及雜菌的發生。如果確需化學藥劑作輔助治療，則要選用高效、低毒、低殘留的藥劑，並做到適時、適量、合理使用。
綠霉病症狀：初期在培養料、椴木接種孔或子實體上長有白色、纖細的菌絲，幾天之後便可形成分生孢子，一旦分生孢子大量形成或成熟、菌落變為綠色、粉狀、無固定形狀，包括綠色木黴菌、康氏木黴菌、木素木黴菌。綠色木黴菌廣泛存在於自然界的各種有機物質上和土壤中，空氣中也漂浮著綠色木黴菌的分生孢子。袋料栽培黑木耳，各種機會都有可能將病菌孢子帶入木屑、麩皮、玉米芯等培養料中，並在生長勢弱的子實體上形成菌落，采耳後的耳根很容易受綠黴菌的感染。該菌適於高溫、高濕和培養料偏酸性的條件下生長，主要靠分生孢子借空氣傳播。防治措施：
①保持周圍環境的清潔衛生；
②耳房、耳場通風良好，排水便利；
③出耳後每3天噴1次1%石灰水；
④使用新鮮的培養料，嚴格把好滅菌關；
⑤防止棉塞受潮，菌袋破損，接種要進行無菌操作；
⑥若發現袋料栽培黑木耳開口處有綠霉污染，可用石灰乳膏或甲醛液塗沫；
⑦若綠黴菌發生在培養料的表面，尚未深入料內時，可用pH為10的石灰水擦洗，也可用菇農樂、甲醛等注射，然後用透明膠布封住，可控制綠黴菌的生長。青黴、毛霉、鏈孢霉等防治方法同上。
爛耳又名流耳。黑木耳的爛耳是細胞充水破裂的一種生理障礙現象。症狀：耳片成熟後耳片變軟，耳片甚至耳根自溶腐爛。耳片成熟如果不及時採收，遇高溫、高濕、光照差、通風不良，常造成大面積爛耳。遭受細菌和害蟲的危害也是造成爛耳的原因。袋料栽培黑木耳，培養料過濕、酸鹼度過高或過低，都會影響黑木耳正常生長而造成爛耳。防治措施：
①加強栽培管理，注意通風換氣、光照等；
②及時採收、耳片接近成熟或已經成熟立即採收；
③用木刀刮除爛耳，用1%～3%生石灰水洗刷；
④大面積發生爛耳時可用0.5%菇病靈藥液噴施防治；
⑤合理安排出耳期，避開高溫、高濕季節。
褐輪軔革菌俗名金邊蛾。症狀：初期該菌子實體革質，平伏於耳木表面，後期邊緣反卷，往往相互連接成覆瓦狀，基部突起，邊緣完整，菌蓋表面有絨毛，里褐色，邊緣淺灰褐色。有數圈同心環溝，外圈絨毛較長，成熟後逐漸變得光滑並褪至淡色。該菌是黑木耳椴木上普遍發生的有害菌，嚴重時可使木耳絕收。該病與菌絲生長時多雨及椴木含有較多水分有關，子實體的形成與陽光直射在椴木上有極顯著的關聯。防治措施：降低空氣濕度和椴木含水量，防止光線直射在椴木上。
牛皮箍症狀：常見耳木上有黑、白兩種，黑的呈粟褐色，白的為筍片色。牛皮箍的發生特點是緊緊貼生於耳木上，狀似貼膏藥，邊緣不翹起，以此可與金邊蛾雜菌區別。牛皮箍是一種較為嚴重的危害木耳的雜菌，陰濕、連雨天氣容易發生，嚴重時貼滿耳木，引起耳木粉狀腐朽，被害耳木不長耳芽，為椴木栽培黑木耳中的一種毀滅性病害。防治措施：耳木避免陽光直射，耳堆注意通風換氣，加強管理，做到勤翻杆、勤洒水、勤除草，剔除蔭蔽過大的樹枝、灌木，雨後要特別注意清溝排漬，嚴防耳場積水。及時用小刀把菌體及附近被腐蝕的木質刮除，刮削的傷口可用3%～5%來蘇兒液塗刷，抑制雜菌蔓延。感染嚴重的要及時剔除，送到耳場外焚燒或掩埋。
黑光偽步甲俗名黑殼子蟲或魚兒蟲，是椴木栽培黑木耳的主要害蟲之一。成蟲黑色，有光澤，長橢圓形；卵乳白色，長橢圓形，表面光滑；幼蟲老熟體壁堅硬，棕褐色；蛹為裸蛹，淺黃色。防治方法：冬、春季徹底清除耳場內的殘株及附近的磚、石、瓦塊、枯枝落葉或爛草等，集中處理或燒掉。3～4月，在越冬成蟲活動期間，用200倍液的敵敵畏噴洒地面。當年接種的耳杆，最好排在陽坡上，耳杆兩端墊小枕木，以利陽光照射和空氣流通，抑制黑光偽步甲的發生。在采耳翻杆時，發現有蟲，要及時捕捉殺死。
食用菌病、蟲及雜菌的防治一定要貫徹「預防為主、綜合防治」的方針。要特彆強調環境衛生和改進栽培技術措施的作用，選擇生長勢好、抗逆性強的品種，控制病、蟲及雜菌的發生。如果確需化學藥劑作輔助治療，則要選用高效、低毒、低殘留的藥劑，並做到適時、適量、合理使用。
綠霉病症狀：初期在培養料、椴木接種孔或子實體上長有白色、纖細的菌絲，幾天之後便可形成分生孢子，一旦分生孢子大量形成或成熟、菌落變為綠色、粉狀、無固定形狀，包括綠色木黴菌、康氏木黴菌、木素木黴菌。綠色木黴菌廣泛存在於自然界的各種有機物質上和土壤中，空氣中也漂浮著綠色木黴菌的分生孢子。袋料栽培黑木耳，各種機會都有可能將病菌孢子帶入木屑、麩皮、玉米芯等培養料中，並在生長勢弱的子實體上形成菌落，采耳後的耳根很容易受綠黴菌的感染。該菌適於高溫、高濕和培養料偏酸性的條件下生長，主要靠分生孢子借空氣傳播。防治措施：
①保持周圍環境的清潔衛生；
②耳房、耳場通風良好，排水便利；
③出耳後每3天噴1次1%石灰水；
④使用新鮮的培養料，嚴格把好滅菌關；
⑤防止棉塞受潮，菌袋破損，接種要進行無菌操作；
⑥若發現袋料栽培黑木耳開口處有綠霉污染，可用石灰乳膏或甲醛液塗沫；
⑦若綠黴菌發生在培養料的表面，尚未深入料內時，可用pH為10的石灰水擦洗，也可用菇農樂、甲醛等注射，然後用透明膠布封住，可控制綠黴菌的生長。青黴、毛霉、鏈孢霉等防治方法同上。
爛耳又名流耳。黑木耳的爛耳是細胞充水破裂的一種生理障礙現象。症狀：耳片成熟後耳片變軟，耳片甚至耳根自溶腐爛。耳片成熟如果不及時採收，遇高溫、高濕、光照差、通風不良，常造成大面積爛耳。遭受細菌和害蟲的危害也是造成爛耳的原因。袋料栽培黑木耳，培養料過濕、酸鹼度過高或過低，都會影響黑木耳正常生長而造成爛耳。防治措施：
①加強栽培管理，注意通風換氣、光照等；
②及時採收、耳片接近成熟或已經成熟立即採收；
③用木刀刮除爛耳，用1%～3%生石灰水洗刷；
④大面積發生爛耳時可用0.5%菇病靈藥液噴施防治；
⑤合理安排出耳期，避開高溫、高濕季節。
褐輪軔革菌俗名金邊蛾。症狀：初期該菌子實體革質，平伏於耳木表面，後期邊緣反卷，往往相互連接成覆瓦狀，基部突起，邊緣完整，菌蓋表面有絨毛，里褐色，邊緣淺灰褐色。有數圈同心環溝，外圈絨毛較長，成熟後逐漸變得光滑並褪至淡色。該菌是黑木耳椴木上普遍發生的有害菌，嚴重時可使木耳絕收。該病與菌絲生長時多雨及椴木含有較多水分有關，子實體的形成與陽光直射在椴木上有極顯著的關聯。防治措施：降低空氣濕度和椴木含水量，防止光線直射在椴木上。
牛皮箍症狀：常見耳木上有黑、白兩種，黑的呈粟褐色，白的為筍片色。牛皮箍的發生特點是緊緊貼生於耳木上，狀似貼膏藥，邊緣不翹起，以此可與金邊蛾雜菌區別。牛皮箍是一種較為嚴重的危害木耳的雜菌，陰濕、連雨天氣容易發生，嚴重時貼滿耳木，引起耳木粉狀腐朽，被害耳木不長耳芽，為椴木栽培黑木耳中的一種毀滅性病害。防治措施：耳木避免陽光直射，耳堆注意通風換氣，加強管理，做到勤翻杆、勤洒水、勤除草，剔除蔭蔽過大的樹枝、灌木，雨後要特別注意清溝排漬，嚴防耳場積水。及時用小刀把菌體及附近被腐蝕的木質刮除，刮削的傷口可用3%～5%來蘇兒液塗刷，抑制雜菌蔓延。感染嚴重的要及時剔除，送到耳場外焚燒或掩埋。
黑光偽步甲俗名黑殼子蟲或魚兒蟲，是椴木栽培黑木耳的主要害蟲之一。成蟲黑色，有光澤，長橢圓形；卵乳白色，長橢圓形，表面光滑；幼蟲老熟體壁堅硬，棕褐色；蛹為裸蛹，淺黃色。防治方法：冬、春季徹底清除耳場內的殘株及附近的磚、石、瓦塊、枯枝落葉或爛草等，集中處理或燒掉。3～4月，在越冬成蟲活動期間，用200倍液的敵敵畏噴洒地面。當年接種的耳杆，最好排在陽坡上，耳杆兩端墊小枕木，以利陽光照射和空氣流通，抑制黑光偽步甲的發生。在采耳翻杆時，發現有蟲，要及時捕捉殺死。
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