魚苗和魚種應規格一致，軀體勻稱，背尾飽滿，鱗鰭完整無創傷，遊動活潑。應在可看到魚苗鰾點出齊、開口吃食、體呈淡黑色時起運。如運輸時間在12小時以上時，體色還應淺些。孵出時間長、體色已經變黑色或鰾點尚看不清的魚苗，不宜長途運輸。魚種起運前1天～3天必須拉網鍛鍊，使魚體預先排空腸內糞便和減少體表粘液，體質結實，習慣密集環境適應長途運輸，以提高運輸的存活率。 運輸魚苗和魚種的水溫為8℃～22℃，在此範圍內溫度越低越好。運輸魚苗的水溫應控制在10℃～20℃，運魚種的水溫應控制在8℃～15℃。水溫在0℃以下時，不宜運輸。夏季高溫時，可用冰塊降溫運輸。 運輸用水要求水質清潔、溶氧量高、無毒無臭味，不受任何污染。途中需要換水時，每次換水量一般不超過1／2，最多不超過2／3，以防止水環境突變。到達目的地下塘時，應測量水溫。運輸魚苗的水溫與池塘水溫相差不得超過2℃，運輸魚種的水溫與池塘水溫相差不得超過5℃。另外，可以在運輸用水中放點食鹽，使水的鹽濃度達到1.5％，以調節魚體內外滲透壓和防治魚種外出血及感染；或者預先放入獸用青黴素或鏈黴素（每立方米水體400萬～800萬國際單位），以防魚病發生和運輸中水質變壞。 要保證魚苗和魚種在運輸途中有足夠的氧氣。除密封充氧外，可用送氣、淋水、換水等形式增氧。還可以帶氧氣瓶充氧和配備雙氧水、增氧靈等增氧藥品。在啟運前，最好作一次裝載密度試驗，選擇合適的密度作為參考。例如在水溫20℃左右、運輸需走6小時～8小時的情況下，0.4m3帆布簍可裝運魚苗約12萬～15萬尾或5cm～7cm的魚種約1萬～1.2萬尾。此外，運輸時不宜喂餌，以免影響水質和消耗氧氣，增加死亡率；低壓悶熱的天氣也不宜運輸。
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