畸形菇的表現形式多種多樣，生產上常見的主要有：地雷菇、空心菇、大屁股菇、硬開傘和早開傘、紅根、水銹斑。
地雷菇。形成的原因主要是覆土材料過粗，土質偏硬，覆土較厚，覆土層表層含水較少，而其下部及基料的溫濕條件又適合子實體發生和生長，故易在料表或覆土層中下層分化形成子實體，然後鑽出土面。解決辦法：選取優質腐殖土，最好使用草炭土，可按比例摻入一定量的腐熟牛糞或麥糠等；在取土、曬土過程中，應予過篩，使土粒大多保持與小麥粒大小相當，最大的可有玉米粒的1/2左右，並伴有部分土粒；覆土一般3厘米左右即可，有條件的可先覆一層厚1～1.5厘米的粗土，後覆細土，並注意保持均勻的含水量。
空心菇。是由於覆土層含水不足，或基料含水偏低，使菇體對維持正常生長的水分的需求得不到滿足而形成的。除解決覆土層含水問題外，適當的棚濕是有效的輔助手段，一般可調控在85～90%的範圍內，過高過低均不利。
大屁股菇。形成的原因是棚溫驟升驟降，溫差幅度大，或受冷、熱空氣襲擊，菌蓋菌柄生長不平衡；或因棚濕過低，而覆土層含水適宜等原因，均可發生大屁股菇。此外，某些化學藥物也可導致該種畸形菇的發生。
硬開傘。形成的原因是菇室晝夜溫差超過10℃，或遇冷空氣襲擊造成的硬開傘。出菇密度過大，溫度過高，濕度過低以及子實體生長快而柄細蓋薄等，均會造成早開傘。防止方法是在溫度聚變時房外加蓋帳簾，保持室內溫濕度的基本穩定。
紅根。出菇前高溫階段用水過多，覆土層含水量過大，培養料偏酸以及追施糖料過多、通風不良等都可能形成紅根。應注意使覆土的含水量保持在22～25%之間，避開高溫時噴水。追肥要適當，糖分要適量。如發現紅根，可適當噴些石灰清水。
水銹斑。在蘑菇多次噴水後，要求打開門窗0.5～1小時通風換氣。否則，菇房內濕度過大，就會使蘑菇表面滯留小水滴，時間稍長形成鐵鏽色斑點。
此外，某些藥物、油類物質及氣體如農村常用的柴油，食用菌上常用的敵敵畏，加溫火爐產生的一氧化碳、二氧化碳等，還可導致其他若干種畸形菇發生，應根據具體情況，認真分析原因，對症下藥，以免生產受損。
地雷菇。形成的原因主要是覆土材料過粗，土質偏硬，覆土較厚，覆土層表層含水較少，而其下部及基料的溫濕條件又適合子實體發生和生長，故易在料表或覆土層中下層分化形成子實體，然後鑽出土面。解決辦法：選取優質腐殖土，最好使用草炭土，可按比例摻入一定量的腐熟牛糞或麥糠等；在取土、曬土過程中，應予過篩，使土粒大多保持與小麥粒大小相當，最大的可有玉米粒的1/2左右，並伴有部分土粒；覆土一般3厘米左右即可，有條件的可先覆一層厚1～1.5厘米的粗土，後覆細土，並注意保持均勻的含水量。
空心菇。是由於覆土層含水不足，或基料含水偏低，使菇體對維持正常生長的水分的需求得不到滿足而形成的。除解決覆土層含水問題外，適當的棚濕是有效的輔助手段，一般可調控在85～90%的範圍內，過高過低均不利。
大屁股菇。形成的原因是棚溫驟升驟降，溫差幅度大，或受冷、熱空氣襲擊，菌蓋菌柄生長不平衡；或因棚濕過低，而覆土層含水適宜等原因，均可發生大屁股菇。此外，某些化學藥物也可導致該種畸形菇的發生。
硬開傘。形成的原因是菇室晝夜溫差超過10℃，或遇冷空氣襲擊造成的硬開傘。出菇密度過大，溫度過高，濕度過低以及子實體生長快而柄細蓋薄等，均會造成早開傘。防止方法是在溫度聚變時房外加蓋帳簾，保持室內溫濕度的基本穩定。
紅根。出菇前高溫階段用水過多，覆土層含水量過大，培養料偏酸以及追施糖料過多、通風不良等都可能形成紅根。應注意使覆土的含水量保持在22～25%之間，避開高溫時噴水。追肥要適當，糖分要適量。如發現紅根，可適當噴些石灰清水。
水銹斑。在蘑菇多次噴水後，要求打開門窗0.5～1小時通風換氣。否則，菇房內濕度過大，就會使蘑菇表面滯留小水滴，時間稍長形成鐵鏽色斑點。
此外，某些藥物、油類物質及氣體如農村常用的柴油，食用菌上常用的敵敵畏，加溫火爐產生的一氧化碳、二氧化碳等，還可導致其他若干種畸形菇發生，應根據具體情況，認真分析原因，對症下藥，以免生產受損。
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