選擇鑑定機構進行鑑定是一件非常重要的事。不同地區之間的司法鑑定機構在評殘級別上相差很大，在相同地區的司法鑑定機構的評殘程序及標準也不一致。一般情況而言，當事人只能在受傷地或住院地的司法鑑定機構進行傷殘鑑定，因此，當事人在選擇司法鑑定機構時要十分謹慎。
1. 選擇有合法資質的鑑定機構
有合法資質的鑑定機構作出的鑑定結論才合法有效，法鑑定機構超出登記的業務範圍作出的鑑定結論無效。因此，應選擇有資質的鑑定機構進行鑑定。如精神病鑑定須選擇到有鑑定精神病資質的司法鑑定機構去做，這樣的鑑定結論才合法、精準可靠。
據2006年06月01日的《華夏時報》報道：5月25日，北京市房山區人民法院開庭審理亢偉志被農用車撞傷賠償案。原告亢偉志向被告李建合索要醫療費、殘疾補償金等15萬餘元賠償。在答辯階段，被告代理人向法庭提出抗辯理由稱，原告索要賠償最重要的依據，是北京公安局法醫鑑定中心所做的傷殘評定書，但據她調查，該鑑定中心沒有鑑定資質，因此該傷殘評定書是無效的。其法律依據是，2005年2月28日，第十屆全國人民代表大會常務委員會第十四次會議通過《全國人民代表大會常務委員會關於司法鑑定管理問題的決定》。該決定自2005年10月1日起施行。《決定》第七條規定，偵查機關根據偵查工作的需要設立的鑑定機構，不得面向社會接受委託從事司法鑑定業務。庭審最後，法官表示，根據被告的答辯，以及法院的調查，發現北京市公安局法醫鑑定中心不具備鑑定資質，因此認為原告提供的法醫鑑定中心的傷殘鑑定無效，法院不予採信。上述案例提醒我們，如果你打算向公安交警部門申請傷殘鑑定，一定要三思而後行，因為大多數情況下公安交警部門會指定自己部門內部設立的鑑定中心來做鑑定，而這種做法的後果往往可能導致傷殘評定書無效，所以，我們建議，受害者最好在律師的指導下選擇合法有效的鑑定機構。
2.選擇信譽卓著、辦事公正的司法鑑定機構
如果選定一家鑑定機構，雖然做出的鑑定級別很高，但是並不權威，需要重新鑑定，那是得不償失，因此選擇鑑定機構一定要選擇那種信譽卓著、辦事公正，其所做的司法鑑定很少甚至基本不會被推翻的司法鑑定機構。
當事人做鑑定時，一般選擇有關交警部門推薦的或很少被保險公司提起重新鑑定的司法鑑定機構。我們不主張當事人到非交警部門指定的司法鑑定機構去做鑑定，除非這家鑑定機構是大學的司法鑑定機構或公立醫院的司法鑑定機構。
3. 不要選擇對自己不利的鑑定機構
每一地區，具備做交通事故傷殘鑑定資質的機構都不止一家。一般情況下各鑑定機構所做的鑑定結論是一致的，但是，當傷情屬於 “可評可不評，可高評可低評”的情況時，各鑑定機構的做法卻不一致，有的鑑定機構的就高不就低，有的就低不就高。所以，不要盲目的自己去選擇鑑定單位，最好是聽取交通事故專業律師的意見，因為，律師對各鑑定機構情況比較了解，否則，吃虧了都不知道怎麼回事。
要知道，評上級別和評不上級別，裡面的賠償項目和金額差距是很大的;同樣的傷情，不同的評級，賠償金額也會有幾萬元甚至十幾萬元的差距。
4.選擇在當地有辦公場所的鑑定機構
有的鑑定機構在當地沒有辦事機構，選擇這種鑑定機構做鑑定會存在以下問題：一是需要補充或重新鑑定時不及時;二是需要解釋或出庭作證時不方便。
1. 選擇有合法資質的鑑定機構
有合法資質的鑑定機構作出的鑑定結論才合法有效，法鑑定機構超出登記的業務範圍作出的鑑定結論無效。因此，應選擇有資質的鑑定機構進行鑑定。如精神病鑑定須選擇到有鑑定精神病資質的司法鑑定機構去做，這樣的鑑定結論才合法、精準可靠。
據2006年06月01日的《華夏時報》報道：5月25日，北京市房山區人民法院開庭審理亢偉志被農用車撞傷賠償案。原告亢偉志向被告李建合索要醫療費、殘疾補償金等15萬餘元賠償。在答辯階段，被告代理人向法庭提出抗辯理由稱，原告索要賠償最重要的依據，是北京公安局法醫鑑定中心所做的傷殘評定書，但據她調查，該鑑定中心沒有鑑定資質，因此該傷殘評定書是無效的。其法律依據是，2005年2月28日，第十屆全國人民代表大會常務委員會第十四次會議通過《全國人民代表大會常務委員會關於司法鑑定管理問題的決定》。該決定自2005年10月1日起施行。《決定》第七條規定，偵查機關根據偵查工作的需要設立的鑑定機構，不得面向社會接受委託從事司法鑑定業務。庭審最後，法官表示，根據被告的答辯，以及法院的調查，發現北京市公安局法醫鑑定中心不具備鑑定資質，因此認為原告提供的法醫鑑定中心的傷殘鑑定無效，法院不予採信。上述案例提醒我們，如果你打算向公安交警部門申請傷殘鑑定，一定要三思而後行，因為大多數情況下公安交警部門會指定自己部門內部設立的鑑定中心來做鑑定，而這種做法的後果往往可能導致傷殘評定書無效，所以，我們建議，受害者最好在律師的指導下選擇合法有效的鑑定機構。
2.選擇信譽卓著、辦事公正的司法鑑定機構
如果選定一家鑑定機構，雖然做出的鑑定級別很高，但是並不權威，需要重新鑑定，那是得不償失，因此選擇鑑定機構一定要選擇那種信譽卓著、辦事公正，其所做的司法鑑定很少甚至基本不會被推翻的司法鑑定機構。
當事人做鑑定時，一般選擇有關交警部門推薦的或很少被保險公司提起重新鑑定的司法鑑定機構。我們不主張當事人到非交警部門指定的司法鑑定機構去做鑑定，除非這家鑑定機構是大學的司法鑑定機構或公立醫院的司法鑑定機構。
3. 不要選擇對自己不利的鑑定機構
每一地區，具備做交通事故傷殘鑑定資質的機構都不止一家。一般情況下各鑑定機構所做的鑑定結論是一致的，但是，當傷情屬於 “可評可不評，可高評可低評”的情況時，各鑑定機構的做法卻不一致，有的鑑定機構的就高不就低，有的就低不就高。所以，不要盲目的自己去選擇鑑定單位，最好是聽取交通事故專業律師的意見，因為，律師對各鑑定機構情況比較了解，否則，吃虧了都不知道怎麼回事。
要知道，評上級別和評不上級別，裡面的賠償項目和金額差距是很大的;同樣的傷情，不同的評級，賠償金額也會有幾萬元甚至十幾萬元的差距。
4.選擇在當地有辦公場所的鑑定機構
有的鑑定機構在當地沒有辦事機構，選擇這種鑑定機構做鑑定會存在以下問題：一是需要補充或重新鑑定時不及時;二是需要解釋或出庭作證時不方便。
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