專業回答
是的，跟團出國游，導遊不建議離境走電子通道，是有原因的，經常出國的人一般都知道為什麼，我來詳細的說說這個問題吧。
圖：機場人工離境通道
第一，回國需要「銷簽」的原因
跟團游，一般都是由旅行社統一辦理簽證，有些國家由於擔心遊客滯留不歸，在申請簽證的時候，不僅需要旅行社擔保，還要求遊客返回國內的時候，統一收繳護照到大使館「銷簽」，證明該旅遊團成員按期離境回國，沒有出現滯留現象，怎麼證明已經按時回國呢，護照簽證頁上面人工敲的離境章就可以證明，如果走了電子自助通道，雖然也可以查找依據來證明，但是沒有出入境的「離境章」直觀。
圖：新加坡樟宜國際機場自助值機（2020年1月攝）
第二，保持隊形，容易匯聚
跟團游的遊客中，可能有老年朋友，也可能有第一次出國的朋友，在離境時，雖然關內與關外就一道閘機之隔，卻屬於「境內」與「境外」，出了關就不能再進，如果大家不能保持「隊形」，有人從人工口離境，有人從自助通道走，領隊不便於協調，更不便於匯聚，容易走散。
第三，防止出現意外情形
本來電子通道是更省事，效率更高的出境方式，但是由於遊客各自身份不同，在使用自助操作時可能並不方便，一旦個別遊客遇到無法通過，就會導致整隊堵塞，效率更低。比如不會操作自助，或者不能識別護照信息，或者戴帽子、圍圍巾，指紋讀取無效等原因，都可能產生延誤，還不如走人工通道呢。
其實，走人工通道有很多好處，我出行過幾十個國家，只要不是趕時間，只要有人工通道，我一般都不選擇走自助電子閘口，護照簽證頁上蓋一個章，我覺得不僅有紀念意義，對以後申請其它國家的簽證更是增加了「含金量」，也減少不必要的麻煩和解釋。
2020年1月我從廣州白雲機場出境走的是自助通道，沒有出境章，回國時在深圳口岸入境，結果，自助不能識別，改走人工通道，邊檢找不到我的出境章，折騰好一會，儘管也通過了，嘿嘿，十分尷尬！
所以，個人建議，能走人工通道我還是喜歡走人工！
其他回答1
其實離境走電子通道更便捷！至於導遊為什麼不建議？我覺得導遊是為了好帶隊好管理：
什麼護照走電子通道？走電子通道程序？有什麼注意事項？
2013年以後的護照，已經採集了十指指紋和面貌的都可以持護照走人口通道。
先走第一道門，把護照放在檢驗口上，門開後進入，第二道門前看鏡頭，手指按到指紋驗證器上，如果食指辨認不了，換一個指頭再驗，不要著急。我見過有著急的，看那邊已經走人工通道過的同伴，他就著急，衝着第二道門拍打的，要跨第二道門的，國內警察比較溫和，教育一番，也曾有破壞這道門的，直接被拘了。要記住，這是國門！你沒驗證這是硬闖國門！
另外，通道僅限一人通過，通過後，第二個人才能進入。所以帶小孩的，帶老人的還是走人工通道。導遊也是這麼考慮的，不讓大家走電子通道，實則是為了自己方便好管理，過了關也好聚攏隊伍。
沒有蓋章無法銷簽？
這其實是您不懂，出了電子通道，在旁邊有一台出入境憑條印表機，出入境憑條與您的護照上的驗訖章具有同樣的效力！可以拿去領館去銷簽，如果您不放心，可以到人工蓋章那裡，請邊檢民警蓋驗訖章就行了，很方便的。
導遊為什麼不建議？因為她們嫌麻煩，跟團游的大部分是第一次出國，這個不明白，那個不明白，走電子通道一窩蜂，再四處找導遊，再找邊檢民警，導遊們不好聚攏，所以全走人工通道對於導遊來說最方便。
綜上所述，出國走人工通道與電子通道是一樣的，如果要銷簽，過了通道後在旁邊的出入境憑條印表機列印一份就行，或者在蓋章處蓋驗訖章。導遊不建議走電子通道，實則是為了自己方便帶隊。
出入境電子通道
毀我塑我 一個過客獨自行走在他鄉
其他回答2
因為你們出行時的簽證跟回來時不一樣。
跟旅遊團，簽證也是經由旅遊團辦理的，很大可能是團隊簽證，團隊簽證跟個人簽證是不一樣的，所以不能跟個人那樣。
既然出去旅遊了，選擇了旅遊團，那麼你們就是一個集體，沒必要為了快速反而拖慢整體節奏。
所以旅行社會統一辦理出行人員的各項事宜，也不用個人單獨去操心。
跟團游主要就是省心，去的風景也都是不會出差錯的。但就像樓主的這個問題，跟團游也有利有弊。
一個人旅行要為行程各種規劃，但是要走到哪裡怎麼走休息多久，都是自己可以說了算的。
跟團和自助，各有優點吧！
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